高通量qPCR芯片介紹（2）？
一、抗生素抗性基因芯片檢測
1、什么是抗生素抗性基因芯片檢測？
針對383個抗生素抗性基因設計的對應qPCR引物包裝至薄層金屬合金納米孔芯片得到高通量qPCR芯片，基于SmartChip Real-Time PCR System可對多個樣本進行高效性、高通量、高精確性和高靈敏度的目標基因檢測和定量計算。同時搭建高通量自動微量加樣和基因定量分析平臺，可一次性高速完成5184個反應和數據分析，規避了以往傳統qPCR方法的基因檢測單一化、費用成本高和效率低等等缺點。
2、抗生素抗性基因芯片檢測優勢
（1）檢測通量高，383個抗生素抗性基因同時檢測；
（2）樣本用量低，構建納升級別反應體系；
（3）絕對定量，根據16S rRNA的絕對定量信息換算所有基因的絕對定量信息；
（4）特異性高，對文獻及數據庫收錄的引物反復實驗獲取高特異性引物。
3、應用方向
?（1）抗生素抗性基因分布特征；
?（2）抗生素抗性基因傳播機制研究。
4、實驗流程
樣本準備-> 核酸提取-> qPCR芯片反應-> 數據處理
5、分析流程
6、樣本要求
土壤、淤泥、沉積物：≥ 3 g
糞便：≥ 1 g
水樣濾膜：≥ 1 張
拭子樣本：≥ 2 個
DNA：濃度≥ 20 ng/μL；總量≥ 2 ng
7、技術參數
生物學重復：微生物樣本重復數≥3個；
檢測系統：SmartChip Real-Time PCR System
項目周期：25個工作日
8、結果展示
（1）基因檢測統計
根據各基因在各樣本中的Ct值統計出基因檢測情況，其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，在表格中標注“1”代表該基因在對應樣本中檢出。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性。
（2）基因定量總表
根據SmartChip Real-Time PCR System和Canco軟件給出的各基因在各樣本中的Ct值，根據相對定量 = 10^(31-Ct)/(10/3)公式，計算得出各基因在各樣本中的相對定量信息。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中相對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，而表格中的數值代表該基因在對應樣本中的定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的定量越高。
（3）基因絕對定量
根據16S rRNA基因的絕對定量換算得到各基因在各樣本中的絕對定量信息，公式如下：
16S相對定量/16絕對定量=基因相對定量/基因絕對定量
表格中數值代表在對應樣本中每微升的基因拷貝數量，而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中絕對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，表格中的數值代表該基因在對應樣本中的絕對定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的絕對定量越高。
二、環境糞便污染溯源芯片檢測
1、什么是環境糞便污染溯源芯片檢測
針對23個環境糞便污染溯源基因設計的對應qPCR引物包裝至薄層金屬合金納米孔芯片得到高通量qPCR芯片，基于SmartChip Real-Time PCR System可對多個樣本進行高效性、高通量、高精確性和高靈敏度的目標基因檢測和定量計算。同時搭建高通量自動微量加樣和基因定量分析平臺，可一次性高速完成5184個反應和數據分析，規避了以往傳統qPCR方法的基因檢測單一化、費用成本高和效率低等等缺點。
2、環境糞便污染溯源芯片檢測優勢
（1）檢測通量高，23個環境糞便污染溯源基因同時檢測；
（2）樣本用量低，構建納升級別反應體系；
（3）絕對定量，根據16S rRNA的絕對定量信息換算所有基因的絕對定量信息；
(4)特異性高，對文獻及數據庫收錄的引物反復實驗獲取高特異性引物。
3、應用方向
?（1）糞便污染溯源；
?（2）環境污染管理措施制定。
4、實驗流程
樣本準備 ->核酸提取-> qPCR芯片反應-> 數據處理
5、分析流程
6、樣本要求
土壤、淤泥、沉積物：≥ 3 g
糞便：≥ 1 g
水樣濾膜：≥ 1 張
拭子樣本：≥ 2 個
DNA：濃度≥ 20 ng/μL；總量≥ 2 ng
7、技術參數
生物學重復：微生物樣本重復數≥3個；
檢測系統：SmartChip Real-Time PCR System
項目周期：25個工作日
8、結果展示
（1）基因檢測統計
根據各基因在各樣本中的Ct值統計出基因檢測情況，其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，在表格中標注“1”代表該基因在對應樣本中檢出。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性。
（2）基因定量總表
根據SmartChip Real-Time PCR System和Canco軟件給出的各基因在各樣本中的Ct值，根據相對定量 = 10^(31-Ct)/(10/3)公式，計算得出各基因在各樣本中的相對定量信息。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中相對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，而表格中的數值代表該基因在對應樣本中的定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的定量越高。
(3)基因絕對定量
根據16S rRNA基因的絕對定量換算得到各基因在各樣本中的絕對定量信息，公式如下：
16S相對定量/16絕對定量=基因相對定量/基因絕對定量
表格中數值代表在對應樣本中每微升的基因拷貝數量，而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中絕對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，表格中的數值代表該基因在對應樣本中的絕對定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的絕對定量越高。
三、病原菌定量芯片檢測
1、什么是病原菌定量芯片檢測
針對69個病原菌基因設計的對應qPCR引物包裝至薄層金屬合金納米孔芯片得到高通量qPCR芯片，基于SmartChip Real-Time PCR System可對多個樣本進行高效性、高通量、高精確性和高靈敏度的目標基因檢測和定量計算。同時搭建高通量自動微量加樣和基因定量分析平臺，可一次性高速完成5184個反應和數據分析，規避了以往傳統qPCR方法的基因檢測單一化、費用成本高和效率低等等缺點。
2、病原菌定量芯片檢測的優勢
（1）檢測通量高，69個病原菌基因同時檢測；
（2）樣本用量低，構建納升級別反應體系；
（3）絕對定量，根據16S rRNA的絕對定量信息換算所有基因的絕對定量信息；
（4）特異性高，對文獻及數據庫收錄的引物反復實驗獲取高特異性引物。
3、應用方向
（1）病原菌豐度和分布特征；
（2）病原菌傳播途徑研究。
4、實驗流程
樣本準備-> 核酸提取-> qPCR芯片反應-> 數據處理
5、分析流程
6、樣本要求
土壤、淤泥、沉積物：≥ 3 g
糞便：≥ 1 g
水樣濾膜：≥ 1 張
拭子樣本：≥ 2 個
DNA：濃度≥ 20 ng/μL；總量≥ 2 ng
7、技術參數
生物學重復：微生物樣本重復數≥3個；
檢測系統：SmartChip Real-Time PCR System
項目周期：25個工作日
8、結果展示
（1）基因檢測統計
根據各基因在各樣本中的Ct值統計出基因檢測情況，其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，在表格中標注“1”代表該基因在對應樣本中檢出。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性。
（2）基因定量總表
根據SmartChip Real-Time PCR System和Canco軟件給出的各基因在各樣本中的Ct值，根據相對定量 = 10^(31-Ct)/(10/3)公式，計算得出各基因在各樣本中的相對定量信息。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中相對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，而表格中的數值代表該基因在對應樣本中的定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的定量越高。
（3）基因絕對定量
采用已知濃度的混合標準質粒的Ct值繪制標準曲線，將目的基因的Ct值代入標準曲線擬合公式，計算公式如下：
Y=kx+b (x為目的基因的Ct值)
表格中數值代表在對應樣本中每微升的基因拷貝數量，而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中絕對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，表格中的數值代表該基因在對應樣本中的絕對定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的絕對定量越高。
1、什么是抗生素抗性基因芯片檢測？
針對383個抗生素抗性基因設計的對應qPCR引物包裝至薄層金屬合金納米孔芯片得到高通量qPCR芯片，基于SmartChip Real-Time PCR System可對多個樣本進行高效性、高通量、高精確性和高靈敏度的目標基因檢測和定量計算。同時搭建高通量自動微量加樣和基因定量分析平臺，可一次性高速完成5184個反應和數據分析，規避了以往傳統qPCR方法的基因檢測單一化、費用成本高和效率低等等缺點。
2、抗生素抗性基因芯片檢測優勢
（1）檢測通量高，383個抗生素抗性基因同時檢測；
（2）樣本用量低，構建納升級別反應體系；
（3）絕對定量，根據16S rRNA的絕對定量信息換算所有基因的絕對定量信息；
（4）特異性高，對文獻及數據庫收錄的引物反復實驗獲取高特異性引物。
3、應用方向
?（1）抗生素抗性基因分布特征；
?（2）抗生素抗性基因傳播機制研究。
4、實驗流程
樣本準備-> 核酸提取-> qPCR芯片反應-> 數據處理
5、分析流程
6、樣本要求
土壤、淤泥、沉積物：≥ 3 g
糞便：≥ 1 g
水樣濾膜：≥ 1 張
拭子樣本：≥ 2 個
DNA：濃度≥ 20 ng/μL；總量≥ 2 ng
7、技術參數
生物學重復：微生物樣本重復數≥3個；
檢測系統：SmartChip Real-Time PCR System
項目周期：25個工作日
8、結果展示
（1）基因檢測統計
根據各基因在各樣本中的Ct值統計出基因檢測情況，其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，在表格中標注“1”代表該基因在對應樣本中檢出。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性。
（2）基因定量總表
根據SmartChip Real-Time PCR System和Canco軟件給出的各基因在各樣本中的Ct值，根據相對定量 = 10^(31-Ct)/(10/3)公式，計算得出各基因在各樣本中的相對定量信息。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中相對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，而表格中的數值代表該基因在對應樣本中的定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的定量越高。
（3）基因絕對定量
根據16S rRNA基因的絕對定量換算得到各基因在各樣本中的絕對定量信息，公式如下：
16S相對定量/16絕對定量=基因相對定量/基因絕對定量
表格中數值代表在對應樣本中每微升的基因拷貝數量，而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中絕對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，表格中的數值代表該基因在對應樣本中的絕對定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的絕對定量越高。
二、環境糞便污染溯源芯片檢測
1、什么是環境糞便污染溯源芯片檢測
針對23個環境糞便污染溯源基因設計的對應qPCR引物包裝至薄層金屬合金納米孔芯片得到高通量qPCR芯片，基于SmartChip Real-Time PCR System可對多個樣本進行高效性、高通量、高精確性和高靈敏度的目標基因檢測和定量計算。同時搭建高通量自動微量加樣和基因定量分析平臺，可一次性高速完成5184個反應和數據分析，規避了以往傳統qPCR方法的基因檢測單一化、費用成本高和效率低等等缺點。
2、環境糞便污染溯源芯片檢測優勢
（1）檢測通量高，23個環境糞便污染溯源基因同時檢測；
（2）樣本用量低，構建納升級別反應體系；
（3）絕對定量，根據16S rRNA的絕對定量信息換算所有基因的絕對定量信息；
(4)特異性高，對文獻及數據庫收錄的引物反復實驗獲取高特異性引物。
3、應用方向
?（1）糞便污染溯源；
?（2）環境污染管理措施制定。
4、實驗流程
樣本準備 ->核酸提取-> qPCR芯片反應-> 數據處理
5、分析流程
6、樣本要求
土壤、淤泥、沉積物：≥ 3 g
糞便：≥ 1 g
水樣濾膜：≥ 1 張
拭子樣本：≥ 2 個
DNA：濃度≥ 20 ng/μL；總量≥ 2 ng
7、技術參數
生物學重復：微生物樣本重復數≥3個；
檢測系統：SmartChip Real-Time PCR System
項目周期：25個工作日
8、結果展示
（1）基因檢測統計
根據各基因在各樣本中的Ct值統計出基因檢測情況，其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，在表格中標注“1”代表該基因在對應樣本中檢出。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性。
（2）基因定量總表
根據SmartChip Real-Time PCR System和Canco軟件給出的各基因在各樣本中的Ct值，根據相對定量 = 10^(31-Ct)/(10/3)公式，計算得出各基因在各樣本中的相對定量信息。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中相對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，而表格中的數值代表該基因在對應樣本中的定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的定量越高。
(3)基因絕對定量
根據16S rRNA基因的絕對定量換算得到各基因在各樣本中的絕對定量信息，公式如下：
16S相對定量/16絕對定量=基因相對定量/基因絕對定量
表格中數值代表在對應樣本中每微升的基因拷貝數量，而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中絕對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，表格中的數值代表該基因在對應樣本中的絕對定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的絕對定量越高。
三、病原菌定量芯片檢測
1、什么是病原菌定量芯片檢測
針對69個病原菌基因設計的對應qPCR引物包裝至薄層金屬合金納米孔芯片得到高通量qPCR芯片，基于SmartChip Real-Time PCR System可對多個樣本進行高效性、高通量、高精確性和高靈敏度的目標基因檢測和定量計算。同時搭建高通量自動微量加樣和基因定量分析平臺，可一次性高速完成5184個反應和數據分析，規避了以往傳統qPCR方法的基因檢測單一化、費用成本高和效率低等等缺點。
2、病原菌定量芯片檢測的優勢
（1）檢測通量高，69個病原菌基因同時檢測；
（2）樣本用量低，構建納升級別反應體系；
（3）絕對定量，根據16S rRNA的絕對定量信息換算所有基因的絕對定量信息；
（4）特異性高，對文獻及數據庫收錄的引物反復實驗獲取高特異性引物。
3、應用方向
（1）病原菌豐度和分布特征；
（2）病原菌傳播途徑研究。
4、實驗流程
樣本準備-> 核酸提取-> qPCR芯片反應-> 數據處理
5、分析流程
6、樣本要求
土壤、淤泥、沉積物：≥ 3 g
糞便：≥ 1 g
水樣濾膜：≥ 1 張
拭子樣本：≥ 2 個
DNA：濃度≥ 20 ng/μL；總量≥ 2 ng
7、技術參數
生物學重復：微生物樣本重復數≥3個；
檢測系統：SmartChip Real-Time PCR System
項目周期：25個工作日
8、結果展示
（1）基因檢測統計
根據各基因在各樣本中的Ct值統計出基因檢測情況，其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，在表格中標注“1”代表該基因在對應樣本中檢出。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性。
（2）基因定量總表
根據SmartChip Real-Time PCR System和Canco軟件給出的各基因在各樣本中的Ct值，根據相對定量 = 10^(31-Ct)/(10/3)公式，計算得出各基因在各樣本中的相對定量信息。而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中相對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，而表格中的數值代表該基因在對應樣本中的定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的定量越高。
（3）基因絕對定量
采用已知濃度的混合標準質粒的Ct值繪制標準曲線，將目的基因的Ct值代入標準曲線擬合公式，計算公式如下：
Y=kx+b (x為目的基因的Ct值)
表格中數值代表在對應樣本中每微升的基因拷貝數量，而只有在三個技術重復中均被檢出的基因，才會將該基因判定為陽性，并計算其平均值作為該基因在對應樣本中絕對定量。其中在表格中標注“0”代表該基因在對應樣本中未檢出，表格中的數值代表該基因在對應樣本中的絕對定量，數值越大意味著該基因在對應樣本中的絕對定量越高。
