4月6日，清明節假期迎來最后一天，鐵路上海站當天迎來返程客流高峰，預計當天的旅客數量將會達到59.3萬人次。

鐵路上海站為了盡量滿足游客出行的需求，實行高峰運行圖，在此基礎上還增開了南昌、蚌埠、徐州、杭州等方向的旅客列車，一共22列。4月7日，金山縣將會實行正常的運行圖。鐵路上海站還對客流情況進行實時關注，通過普通列車加掛車廂、動車組重聯等方式適時的進行，運力的增加。

上海南站為了做好到達客流運輸的工作，從4月4日開始進行免二次安檢的試點。旅客下火車之后，可以不用再次進行安檢，直接從上海南站的3號和4號口進站直接乘坐地鐵。各個戰區也充分地將交通樞紐的優勢發揮出來，加強進行落地協調聯動機制，與市政交通的信息做好溝通和銜接，與公交地鐵等進行協調，延長開行的時間，并且進行開行班次加密安排，確保到站的旅客能夠獲得及時的疏散。